以下对比基于常见住宅系统配置。不同品牌、机型以及是否配置独立新风、除湿、净化和智能控制设备，会影响实际性能。
| 对比项目 | 传统多联机中央空调 | 全空气空调系统 |
| 系统形式 | 一台室外机连接多个室内机，各房间通过室内机直接处理空气。 | 通过集中式Air Handler处理空气，再利用风管输送到各个房间。 |
| 温度控制 | 各室内机可独立调节温度，适合按房间启停。 | 通过集中空气处理和智能分区，可实现房间独立温控及连续小温差运行。 |
| 湿度控制 | 制冷过程中具有一定除湿能力，但通常缺少独立、精确的全屋湿度管理。 | 可结合空调除湿、独立除湿或加湿设备，对全屋湿度进行统一管理。 |
| 新风 | 普通多联机本身通常不负责室外新风，需要另设新风系统。 | 新风可以与Air Handler及风管系统统一规划，并根据人数和项目要求确定新风量。 |
| 空气过滤 | 室内机通常配置基础过滤，需要更高空气品质时可增加独立净化设备。 | 循环回风集中经过Air Handler，便于配置机械过滤、电子净化或其他空气处理模块。 |
| 空气品质 | 需要通过新风、过滤、除湿等独立系统组合实现完整空气品质管理。 | 更容易把温度、湿度、新风、过滤和空气循环统一到一套系统中。 |
| 气流组织 | 主要由每个室内机的送风方式决定，局部送风特征较明显。 | 可以统一设计送风、回风、过流路径和房间气流场，更适合低风速、低风感设计。 |
| 室内末端 | 通常每个主要房间设置一台室内机，并连接冷媒管和冷凝水管。 | 空气处理设备集中设置，主要房间通常只有风管、风阀和送回风口。 |
| 噪声控制 | 房间内有室内机风机，实际噪声与机型、档位及安装质量有关。 | 主要机械设备可远离生活区，通过低风速风管、消声和风口设计实现较低室内噪声。 |
| 智能分区 | 通过各室内机独立启停和设定温度实现房间控制。 | 可通过房间传感器、比例风阀和变速风机动态调节各区域送风量。 |
| 运行能耗 | 高效变频多联机具有较好的部分负荷效率，能耗取决于设备效率和使用方式。 | 可通过变频冷热源、EC风机和按需分区降低不必要运行，但实际能耗取决于建筑负荷、新风量和控制策略。 |
| 维护方式 | 多个室内机、冷凝水系统及冷媒连接点分布在不同房间，维护位置较分散。 | 主要空气处理设备集中维护，但过滤器、风阀、传感器及风管系统仍需要定期检查。 |